python处理dicom图像文件

标签： python

首先需要用到python自带的包pydicom

pip安装
```
pip install pydicom
```
conda安装
```
conda install -c conda-forge pydicom
```

查看dicom图像文件

import pydicom
from pydicom import dcmread

filename = r"/media/ubuntu/Seagate Basic/LIDC-IDRI/LIDC-IDRI-0899/1.3.6.1.4.1.14519.5.2.1.6279.6001.325608968275343627520297346991/1.3.6.1.4.1.14519.5.2.1.6279.6001.216652640878960522552873394709/000002.dcm"
dataset = dcmread('/media/ubuntu/Seagate Basic/LIDC-IDRI/LIDC-IDRI-0899/1.3.6.1.4.1.14519.5.2.1.6279.6001.325608968275343627520297346991/1.3.6.1.4.1.14519.5.2.1.6279.6001.216652640878960522552873394709/000002.dcm')
plt.imshow(dataset.pixel_array,cmap = plt.cm.bone)

在这里插入图片描述

查看数据信息

print(dataset)

在这里插入图片描述

(0008, 0005):元素的标签,16进制；Specific Character Set:元素的名称；CS：元素的值表示；‘ISO_IR_100’:元素的存储值

元素分为三类，对于所有元素类别可通过标签访问数据集中的特定怨怒，该标签返回一个DataElement实例

在这里插入图片描述

删除元素
```
del ds[0x0043, 0x104E]
```
保存修改的图像

通过save_as()将数据集写入提供的路径来完成
```
dataset.save_as('out.dcm')
```
教程

本文链接：https://blog.csdn.net/whysayso/article/details/111936559

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